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Umsetzung bedarf einerseits der Information: Die relevanten und interessierten Ansprechgruppen werden regelmässig und offen über den Stand des NFP 53 und dessen Resultate orientiert. Auch der Austausch zwischen den Forschenden des Programms wird gefördert. Andererseits geht es darum, dass die Resultate des Forschungsprogramms in der Praxis – sei dies in der Medizin, in der Arbeitswelt oder in der Gesundheitspolitik – ausreichend gewürdigt und angewendet werden. Die Umsetzung erfolgt unter anderem über diese Website, über ein Newsletter, mit Veranstaltungen, Publikationen und mit Medieninformationen.
Die Massnahmen, welche für die Umsetzung ergriffen werden, lassen sich grob in drei Phasen einteilen: In der ersten Phase (2004/2005) werden Vorarbeiten für die Umsetzung geleistet. In der zweiten Phase (2005 – 2007) läuft die Kommunikation und der Austausch mit den verschiedenen Partnern an, schliesslich geht es in der dritten Phase (2007 – 2009) um die Umsetzung der Forschungsresultate mittels Publikationen, Veranstaltungen und weiteren Massnahmen.